蘑菇不能和某些食物一起过量食用，比如鹌鹑蛋。有研究表明，蘑菇与鹌鹑蛋一起吃可能会产生不良影响，影响人体对营养的吸收等。
与海鲜类食物
海鲜与蘑菇同吃需注意： 像虾和蘑菇一起大量食用时，可能会在人体内产生不利于健康的物质。因为海鲜中含有较多的砷类物质，正常情况下对人体无害，但如果和某些含有维生素C的食物大量同食时影响不大，但蘑菇若与海鲜搭配不当，可能会影响胃肠道的消化功能。例如长期大量将虾和蘑菇一起过量食用，可能会出现腹胀、腹痛等消化不良的症状。螃蟹和蘑菇： 螃蟹本身属于寒凉性食物，蘑菇也有一定的寒凉属性，两者一起吃过多的话，会加重体内的寒气，尤其是脾胃虚寒的人，更容易出现腹泻等不适症状。一般建议螃蟹和蘑菇分开食用，间隔数小时会相对安全些。
与富含维生素D分解酶的食物
柿子和蘑菇： 柿子中含有维生素C等成分，而蘑菇中含有维生素D分解酶，若大量食用柿子和蘑菇，维生素D分解酶会破坏柿子中的维生素等营养成分，降低食物的营养价值。比如一次性吃很多柿子又吃较多蘑菇，就可能导致柿子中的部分营养不能被有效吸收利用。胡萝卜和蘑菇： 胡萝卜里含有的维生素D分解酶会分解蘑菇中的维生素D，长期这样搭配过量食用，会使蘑菇原本含有的维生素D被破坏，从而影响人体对维生素D的摄取，对身体维持正常的钙磷代谢等有一定不利影响。
与高纤维过多的食物
韭菜和蘑菇： 韭菜本身膳食纤维含量较高，蘑菇也有一定量的膳食纤维，两者一起吃过多时，会加重胃肠道的消化负担。对于胃肠功能较弱的人来说，可能会引起消化不良，出现腹胀、便秘等情况。比如本身胃肠蠕动较慢的人，吃了较多韭菜炒蘑菇后，很可能会感觉肚子不舒服。玉米和蘑菇： 玉米中的膳食纤维含量也不低，蘑菇与之搭配过量食用，会让胃肠道消化起来比较吃力。尤其是消化功能不好的人群，吃后可能会出现消化不良的状况，影响食物的消化吸收过程，长期如此还可能对胃肠功能造成一定损害。