蘑菇不能和一些富含鞣酸的食物一起吃，比如柿子。柿子中含有较多鞣酸，蘑菇中的蛋白质等成分与之结合，可能会形成不易消化的物质，影响胃肠功能。
蘑菇与富含维生素D分解酶食物不宜同食
某些蕈类： 比如raw oyster mushrooms（鲜蚝菇）含有较多维生素D分解酶，若和其他富含维生素D的食物一起吃，可能会破坏食物中的维生素D。像动物肝脏本身富含维生素D，若蘑菇与动物肝脏同食，就可能影响维生素D的吸收利用。蕨类蔬菜： 蕨菜等蕨类蔬菜也含有维生素D分解酶，若与蘑菇一同大量食用，会干扰人体对维生素D的摄取。
蘑菇与高纤维易胀气食物搭配需注意
高纤维蔬菜： 比如菠菜，蘑菇本身消化相对缓慢，菠菜纤维含量较高，两者一起大量食用，会加重胃肠消化负担，可能导致腹胀等不适。一般一顿饭中如果吃了较多蘑菇，就不建议再大量吃菠菜这类高纤维蔬菜。豆类： 绿豆、红豆等豆类食物富含膳食纤维，与蘑菇一起吃，容易在肠道内产气，对于胃肠功能较弱的人来说，可能引发腹胀、腹痛等问题。比如吃了蘑菇炖豆，就可能出现肠胃不适情况。
蘑菇与某些药物同服需谨慎
抗生素类药物： 比如四环素类抗生素，部分蘑菇中的成分可能会影响这类药物的吸收。如果在服用四环素类抗生素期间吃蘑菇，可能降低药物的治疗效果。所以服用这类抗生素时，要注意与蘑菇的食用间隔，一般建议间隔2 - 3小时以上。降压药： 某些蘑菇，如含有酪胺的蘑菇，若与降压药中的单胺氧化酶抑制剂类药物同服，可能会引起血压异常升高。因为单胺氧化酶抑制剂会抑制体内单胺氧化酶的活性，而酪胺在体内积累可能导致血压骤升，所以服用这类降压药的人要避免食用含酪胺较多的蘑菇。