病毒性软疣主要通过局部治疗来去除，比如医生常用镊子将软疣小体夹破，挤出内容物，然后涂抹碘酊等进行消毒，一般处理后1~2周能逐渐恢复。
局部物理治疗方法
镊子夹除： 这是比较常用的方法，医生会用专业镊子精准地将软疣小体逐个夹出，操作时要注意消毒，避免感染。一般夹除后局部会有小伤口，需保持清洁。激光治疗： 利用激光的高能量瞬间破坏软疣组织。激光治疗速度较快，对于较大或数量较多的软疣可能适用，但治疗后局部会有创面，要注意护理，避免沾水，防止感染，通常1周左右创面能愈合。
外用药物治疗情况
维A酸软膏： 维A酸可以调节上皮细胞的生长和分化，对软疣有一定的治疗作用。使用时要局部涂抹，每天1~2次，坚持使用可能会看到效果，但起效相对较慢，一般需要连续使用数周。斑蝥素： 斑蝥素能引起皮肤局部炎症反应，促使软疣脱落。不过使用斑蝥素时要注意避免接触正常皮肤，防止造成不必要的损伤，且使用过程中要观察皮肤反应，如有不适需及时停用。
日常护理注意事项
保持皮肤清洁： 要经常洗澡，保持皮肤干净，尤其是长有软疣的部位，避免细菌滋生，降低感染风险。洗澡时水温不宜过高，以免刺激皮肤。避免搔抓： 软疣部位不要用手搔抓，因为搔抓可能会导致软疣扩散，使更多部位感染软疣病毒。要告诫儿童不要用手去摸长软疣的地方。注意个人物品单独使用： 患者使用的毛巾、衣物等要单独清洗，不与他人混用，防止传染给他人。比如毛巾要定期煮沸消毒，衣物要分开洗涤。