病毒性软疣主要通过局部治疗来去除，一般来说，医生会采用多种方法进行处理。比如常用的有刮除术，医生会用特制的工具将软疣小体完全刮除，这是比较直接的方法。
局部治疗方法
镊子挤压法：对于较小的软疣，医生可以用镊子将软疣夹破，挤出里面的内容物，然后再涂抹一些碘酊等进行消毒，防止感染。一般操作比较简单，但要注意操作要彻底，否则容易复发。冷冻治疗：利用低温的液氮使软疣组织坏死脱落。冷冻治疗后局部可能会出现水疱等情况，通常1 - 2周左右水疱会干涸结痂脱落。冷冻治疗相对安全有效，不过对于一些较大的软疣可能需要多次治疗。激光治疗：用激光的高能量烧灼软疣，使其碳化脱落。激光治疗的优点是速度快，对于单个较大的软疣或者数量不多的软疣效果较好。但治疗后局部会有创面，需要注意保持清洁，避免感染，一般1 - 2周创面可愈合。
日常护理要点
保持皮肤清洁：患者要注意保持长有软疣部位的皮肤清洁卫生，每天可以用温水清洗，但要避免过度搓洗，防止皮肤破损导致病毒传播到其他部位或者引起继发感染。避免搔抓：软疣部位可能会有瘙痒感，患者一定要避免搔抓，因为搔抓可能会导致病毒自身接种，使软疣数量增多。如果瘙痒明显，可以在医生指导下使用一些止痒的药物。注意个人物品卫生：患者使用的毛巾、衣物等个人物品要单独清洗，并且可以用开水烫洗或者在阳光下暴晒，以杀灭可能存在的病毒，防止交叉感染。
特殊人群注意事项
儿童患者：儿童患病毒性软疣时，家长要更加细心护理。因为儿童皮肤比较娇嫩，在治疗过程中要选择温和的治疗方法，如较小的软疣可以优先考虑镊子挤压法，操作要轻柔，避免损伤儿童皮肤。同时要防止儿童搔抓患处，以免影响病情恢复和造成自身传播。孕妇患者：孕妇患病毒性软疣时，治疗要谨慎。一般不建议采用有创性较大的治疗方法，如激光治疗等，可先尝试一些相对温和的局部处理方法，如较小范围的软疣可以先观察或者在医生评估后选择合适的局部消毒等处理方式，要充分考虑对胎儿的影响，严格遵循医生的建议进行处理。