大便肛门出血微疼，可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵裂后形成的小溃疡，通常位于肛管后正中线上，引起肛门疼痛和出血。多因大便干燥、排便用力过猛，导致肛管皮肤裂伤。
2.内痔：以便血和脱出为主要症状，多为无痛软性肿块。内痔可分为四期，不同期别的内痔症状有所不同。
3.外痔：发生于肛管齿状线以下，是痔外静脉丛扩大曲张或反复发炎而成，其表面被皮肤覆盖，不易出血，常伴有疼痛。
4.肛管或直肠肿瘤：肛管、直肠肿瘤溃烂、感染，可出现脓血、黏液血便。
5.其他：肛门裂、肛门皮肤损伤、肛门直肠炎症等也可引起大便肛门出血微疼。
此外，一些全身性疾病，如白血病、血小板减少性紫癜、再生障碍性贫血等，也会引起大便肛门出血微疼。
如果出现大便肛门出血微疼的症状，应及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。同时，应注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物，保持大便通畅，养成良好的排便习惯。