大便肛门出血微疼可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.内痔：肛垫的支持结构、静脉丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位为内痔，常见症状为便血、痔核脱出、肛门瘙痒。内痔分度不同，症状轻重不一。
3.外痔：发生于肛管齿状线以下，是痔外静脉丛扩大曲张或反复发炎而成，其表面被皮肤覆盖，不易出血，常伴有疼痛。
4.肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，随着肿瘤的生长，可出现大便习惯改变、大便带血、肛门疼痛等症状。
5.其他：肛管或直肠的损伤、溃疡性结肠炎、克罗恩病、感染等也可引起大便肛门出血微疼。
如果出现大便肛门出血微疼的症状，建议及时就医，进行相关检查，如肛门指诊、肛门镜检查、结肠镜检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持肛门局部清洁，避免久坐、久站，多吃蔬菜水果，保持大便通畅。