得了毛囊炎可以根据病情选择合适的药物治疗，一般局部外用药物较为常用，比如对于细菌感染引起的毛囊炎，可选用莫匹罗星软膏等，这类药物能抑制细菌生长。通常经过规范用药，多数患者能在数天内改善症状。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏： 主要针对革兰阳性球菌引起的毛囊炎，能阻碍细菌蛋白质合成，起到杀菌作用。它适用于皮肤轻度感染的毛囊炎情况，直接涂抹在患处即可。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的常见细菌，如金黄色葡萄球菌等有较好的抗菌活性，可抑制细菌的繁殖，一般每天涂抹2 - 3次。
抗真菌类药物
酮康唑乳膏： 如果是真菌感染导致的毛囊炎，酮康唑乳膏能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌的生长。它适用于马拉色菌等真菌感染引起的毛囊炎，使用时均匀涂抹在受感染部位。特比萘芬乳膏： 能特异性地干扰真菌固醇的早期生物合成，从而发挥抗真菌作用，对多种皮肤真菌有效，可用于治疗真菌性毛囊炎，每天使用1 - 2次。
中药类外用药
金黄膏： 具有清热解毒、消肿止痛的功效，对于热毒蕴结引起的毛囊炎有一定疗效，将其涂抹在患处，能起到消肿散结的作用。鱼石脂软膏： 有温和的刺激性，可消炎、防腐及消肿，适用于毛囊炎初期红肿疼痛的情况，涂抹后能促进炎症消退。
特殊人群用药注意
儿童： 儿童使用外用药物时要格外小心，尽量选择刺激性小的药物。比如儿童用莫匹罗星软膏时，要在成人监护下使用，避免误入口鼻等。孕妇： 孕妇患毛囊炎用药需谨慎，应先咨询医生。一般不建议自行随意使用药物，医生会根据病情选择相对安全的外用药物来治疗。