间质性肺炎的病因较多，其中约30%的特发性间质性肺炎病因不明。而已知的常见原因有以下几类：
环境因素导致
职业环境接触：长期接触石棉的人，患间质性肺炎的风险会明显增加。比如在石棉矿工作的工人，由于长期吸入石棉纤维，肺部容易受到损伤，进而引发间质性肺炎。还有长期接触煤尘的矿工，也可能逐渐出现间质性肺炎相关病变。室内环境因素：长期吸入发霉的干草、谷物等产生的霉菌孢子，也可能诱发间质性肺炎。比如一些农户长期处于堆满发霉草料的环境中，就可能增加患病几率。
药物因素导致
部分化疗药物：像博来霉素等化疗药物在使用过程中，有一定概率引起间质性肺炎。临床研究发现，使用博来霉素进行化疗的患者中，约有一定比例会出现不同程度的间质性肺炎表现。某些心血管药物：如胺碘酮，长期服用胺碘酮的患者，约有5% - 15%可能会发生间质性肺炎。
疾病因素导致
自身免疫性疾病相关：类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病都可能累及肺部，引发间质性肺炎。以类风湿关节炎为例，约有10% - 30%的类风湿关节炎患者会出现肺间质受累的情况，逐渐发展为间质性肺炎。感染因素：某些病毒感染，如巨细胞病毒、流感病毒等感染后，可能引发间质性肺炎。例如巨细胞病毒感染免疫功能低下的人群时，就容易导致肺部出现间质性炎症改变。