治疗肠炎常用的药物有多种，比如氨基水杨酸制剂，像柳氮磺吡啶，它对轻、中度的溃疡性结肠炎有一定治疗作用。
氨基水杨酸制剂类
柳氮磺吡啶：主要用于轻、中度溃疡性结肠炎的治疗，它可以在肠道内分解为磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸能够抑制肠道炎症。美沙拉嗪：也是常见的氨基水杨酸制剂，有多种剂型，如缓释片、灌肠剂等，对于结肠炎患者，轻、中度的可选用美沙拉嗪缓释片口服，直肠炎患者可以用美沙拉嗪灌肠剂。
糖皮质激素
泼尼松：对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中度及重度结肠炎患者可以使用。不过长期使用可能会有一些副作用，比如骨质疏松、感染风险增加等。氢化可的松：重症结肠炎患者有时会用到氢化可的松静脉滴注，但使用时要密切监测不良反应，像可能引起血糖升高、电解质紊乱等情况。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤：适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的结肠炎患者，一般需要较长时间服用，起效相对较慢，用药期间要定期监测血常规、肝功能等指标，因为可能会引起白细胞减少、肝功能损害等。巯嘌呤：作用机制与硫唑嘌呤类似，也用于结肠炎的治疗，同样要注意监测血常规和肝功能等。
微生态制剂
双歧杆菌四联活菌片：可以调节肠道菌群，对于肠炎引起的肠道菌群失调有一定的调节作用，它含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等有益菌，能改善肠道的微生态环境。地衣芽孢杆菌活菌胶囊：也能调节肠道菌群，帮助恢复肠道的正常菌群平衡，适用于肠炎导致肠道菌群紊乱的情况。