治疗肠炎的药物有多种，常见的如益生菌类药物，像双歧杆菌四联活菌片，它能调节肠道菌群，一般可用于肠道菌群失调引起的肠炎等肠道疾病，市面上价格大概在20~50元左右（不同规格有差异）。
益生菌类药物
双歧杆菌四联活菌片： 由双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等四种活菌组成，能补充肠道有益菌，抑制有害菌生长，调节肠道微生态平衡，对因肠道菌群紊乱导致的肠炎有一定作用。枯草杆菌二联活菌颗粒： 含有枯草杆菌和肠球菌，可直接补充正常生理菌丛，抑制致病菌，促进营养物质的消化、吸收，抑制肠源性毒素的产生和吸收，适用于肠炎等肠道菌群失调相关疾病。
抗炎类药物
柳氮磺吡啶： 主要用于治疗溃疡性结肠炎等肠炎，它在肠道内分解为磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸可抑制前列腺素合成，从而减轻炎症反应。但对磺胺类药物过敏者禁用。美沙拉嗪： 能抑制引起炎症的前列腺素合成和炎症介质白三烯的形成，对肠炎有抗炎作用，可用于溃疡性结肠炎的治疗，不过严重肝、肾功能不全者慎用。
止泻类药物
蒙脱石散： 对消化道内的病毒、细菌及其产生的毒素有固定、抑制作用，对肠道黏膜有覆盖保护能力，能吸附肠道内多余的水分，起到止泻作用，儿童成人都可使用，一般服用后1~2天可见效。药用炭胶囊： 能吸附导致肠炎腹泻的气体、细菌及其产生的毒素等，减少对肠道的刺激，从而缓解腹泻症状，但不宜与抗生素等同时服用，以免影响药效。
解痉止痛类药物
匹维溴铵片： 为胃肠道解痉药，可选择性作用于胃肠道平滑肌，缓解肠炎引起的腹部痉挛性疼痛，它的副作用相对较少，但孕妇需在医生指导下使用。东莨菪碱片： 也有解痉止痛作用，能解除胃肠道平滑肌痉挛，但青光眼、前列腺肥大患者禁用，儿童使用需谨慎，要根据体重等调整剂量。