患者眼睛出现刺痛、有异物感的处理方式，主要依据其致病原因来确定，并给予相应的对症治疗，具体如下：
一、细菌感染：
若因细菌感染引发细菌性结膜炎或角膜炎，导致患者有眼睛刺痛、异物感的情况，此时需要选用抗生素类眼药水，常见的有左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、氧氟沙星眼膏等。
二、病毒感染：
如果是病毒性结膜炎或角膜炎致使眼睛刺痛、异物感，那就需要用到抗病毒的眼药水及眼膏，例如干扰素眼药水、阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦眼膏等。
三、真菌感染：
当为真菌性角膜炎引起眼睛刺痛、异物感时，需要点抗真菌类眼药水，比如那特霉素眼药水等。
四、异物因素：
针对角膜或结膜异物所导致的眼睛刺痛且伴有异物感，必须挑出异物，同时配合使用抗感染的眼药水以及能促进角膜上皮恢复的眼药水。
总结：对于患者眼睛刺痛、有异物感的情况，要明确致病原因，然后根据不同原因选择合适的治疗手段，如针对细菌、病毒、真菌感染分别使用相应的眼药水，对于异物因素则要挑出异物并配合使用相关眼药水。