肛门直肠脓肿是直肠肛管组织内或其周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。其主要症状有局部疼痛，通常在发病初期就比较明显，尤其是在坐立、行走或排便时疼痛会加重，有的患者疼痛可持续数小时甚至更久。
局部症状表现
红肿热痛： 脓肿部位会出现红肿，用手触摸能感觉到温度比周围正常组织高，同时伴有明显的疼痛。比如肛门周围皮肤发红，范围可能从几厘米到更大区域不等，触摸时疼痛敏感。肿块形成： 可以在肛门周围、直肠腔内等部位摸到肿块，肿块质地比较软，有波动感（这是脓肿成熟的表现之一）。一般来说，发病1 - 2周左右，如果脓肿没有自行吸收，肿块的波动感会比较明显。
全身症状表现
发热： 部分患者会出现发热症状，体温可达到38℃ - 39℃左右，有的甚至更高。发热通常是因为身体对感染的炎症反应，一般在脓肿比较严重的时候更容易出现发热情况。寒战： 随着发热，有些患者还可能伴有寒战，表现为身体不由自主地发抖，这是感染进一步加重，身体应激的一种表现。
其他伴随症状
排便异常： 患者可能会出现排便困难，有里急后重感，也就是总是有想排便的感觉，但又排不净。另外，有的患者大便时疼痛会加剧，还可能出现大便带血的情况，不过出血量一般不多，可能只是粪便表面有少量鲜血。全身不适： 患者会感觉全身乏力、精神不振，食欲也可能会受到影响，不想吃东西，这些都是因为身体处于感染状态，全身机能受到一定影响导致的。