肠道紊乱的用药需根据具体情况而定，比如益生菌类药物可能对部分肠道紊乱有帮助，像双歧杆菌制剂，它能调节肠道菌群，一般可长期服用，但具体效果因个体差异不同。
益生菌类药物：
双歧杆菌四联活菌片： 可以补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，对因肠道菌群失调引起的肠道紊乱有一定作用，适用于成年人肠道菌群失调相关的腹泻、便秘等情况。枯草杆菌二联活菌颗粒： 含有枯草杆菌和屎肠球菌等有益菌，能改善肠道功能，对于儿童因肠道功能不完善导致的肠道紊乱有帮助，比如儿童腹泻、便秘等。
胃肠动力调节药：
多潘立酮： 主要用于促进胃肠蠕动，可缓解因胃肠动力不足引起的腹胀、早饱等肠道紊乱症状，成人常用，但儿童使用需谨慎，要在医生指导下根据年龄等情况使用。莫沙必利： 也是促进胃肠动力的药物，作用机制与多潘立酮类似，适用于功能性消化不良伴有胃灼热、嗳气、恶心、呕吐、早饱、上腹胀等肠道紊乱症状的成人患者。
肠道黏膜保护剂：
蒙脱石散： 可以吸附肠道内的毒素、病菌等，保护肠道黏膜，对于急性腹泻等肠道紊乱情况有一定治疗作用，成人和儿童均可使用，儿童腹泻时可按剂量服用。比如儿童急性腹泻，每次按体重服用相应剂量的蒙脱石散。铝碳酸镁： 能保护胃黏膜和肠道黏膜，可用于缓解因胃酸过多刺激肠道引起的肠道紊乱相关症状，如胃部不适牵连肠道的情况等，成人常用。