干燥综合症的病因目前尚未完全明确，但一般认为与遗传、免疫、感染等因素有关。遗传因素方面，研究发现某些基因的遗传多态性与干燥综合症的发病风险增加相关，有家族遗传史的人群患病几率可能比普通人群高一些。
遗传因素相关
基因关联： 特定的人类白细胞抗原（HLA）基因，如HLA - DR3、HLA - DR4等基因与干燥综合症的易感性有关。携带这些基因的个体，体内免疫系统的调控可能出现异常，使得自身免疫反应更容易被激活，从而增加患干燥综合症的可能性。
免疫因素影响
自身免疫反应： 人体的免疫系统本应保护身体抵御外来病原体，但在干燥综合症患者体内，免疫系统错误地攻击自身的外分泌腺体，尤其是唾液腺和泪腺。例如，患者体内会产生多种自身抗体，如抗核抗体、抗SSA抗体、抗SSB抗体等，这些自身抗体参与了对唾液腺和泪腺等外分泌腺体的损伤过程，导致腺体分泌功能下降，出现口干、眼干等典型症状。
感染因素作用
病毒感染： 某些病毒可能与干燥综合症的发病有关。比如EB病毒、丙型肝炎病毒等。有研究发现，感染这些病毒后，可能会触发人体的免疫反应，打破免疫系统的平衡，进而诱发干燥综合症。例如，EB病毒感染可能会改变人体淋巴细胞的功能和特性，促使自身免疫反应的发生，增加患干燥综合症的风险。