尿道炎主要是由病原体感染引起的，常见的病原体有大肠杆菌等，大约50%的尿道炎是由大肠杆菌导致的。
病原体感染因素
细菌感染： 大肠杆菌是引发尿道炎最常见的细菌之一，它容易从尿道外口入侵，进而感染尿道引发炎症。比如女性由于尿道较短且靠近肛门，大肠杆菌更易侵入引发尿道炎。另外，金黄色葡萄球菌也可能引起尿道炎，它会在尿道黏膜定植繁殖，破坏尿道的正常结构和功能。支原体、衣原体感染： 支原体和衣原体也是导致尿道炎的常见病原体。性生活活跃的人群更容易感染这类病原体，比如15 - 24岁性活跃期的人群感染风险相对较高。支原体、衣原体会黏附在尿道上皮细胞上，影响细胞的正常代谢，引发炎症反应。
尿道局部因素
尿道梗阻： 当存在尿道结石、狭窄等情况时，会导致尿液排出不畅，尿液在尿道内积聚，为病原体的生长繁殖提供了有利环境。例如尿道结石患者，结石堵塞尿道，使尿液流通受阻，长时间就容易引发尿道炎。尿道狭窄患者同样会因为尿液排出受限，增加尿道炎的发病几率。尿道损伤： 尿道器械检查、性生活过于剧烈等都可能造成尿道损伤，损伤后的尿道更容易受到病原体的侵袭。比如进行尿道镜检查时，可能会不小心擦伤尿道黏膜，从而使细菌等病原体有可乘之机，引发尿道炎。性生活中过于粗暴的行为也可能导致尿道损伤，进而诱发炎症。
机体免疫因素
免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂的人群，身体抵御病原体的能力下降，更容易患上尿道炎。糖尿病患者由于血糖水平较高，有利于细菌的生长繁殖，同时自身免疫功能也会受到影响，所以比常人更易发生尿道炎。艾滋病患者免疫系统严重受损，对各种病原体的防御能力极差，尿道炎的发病风险大幅增加。