骨髓炎主要是由细菌感染引起的，其中金黄色葡萄球菌是较为常见的致病菌，约有50% - 70%的骨髓炎是由它导致的。
创伤相关感染引起
外伤导致： 当皮肤出现开放性伤口，比如擦伤、刺伤等，细菌很容易通过伤口侵入骨骼，从而引发骨髓炎。例如，一个人被尖锐的铁器划伤后，如果没有及时正确处理伤口，就可能让细菌进入体内，进而感染骨骼引发骨髓炎。手术后感染： 一些骨科手术，像骨折内固定手术等，在手术过程中或者术后，如果伤口护理不当，也会有细菌感染的风险，从而诱发骨髓炎。比如术后伤口出现红肿、渗液等情况，就有可能是细菌感染导致骨髓炎的先兆。
血源性感染引发
身体其他部位感染扩散： 当人体其他部位有感染病灶时，比如皮肤疖肿、扁桃体炎等，细菌可能会进入血液循环，随着血液流动到达骨骼部位。例如，皮肤疖肿中的细菌进入血液后，有可能随着血流跑到骨骼，在骨骼部位定植繁殖，引起骨髓炎。儿童高发情况： 儿童时期，由于他们的骨骼血供丰富，而且免疫系统相对还不完善，更容易发生血源性骨髓炎。比如儿童长骨的干骺端是血液供应丰富的区域，细菌容易在这个部位停留繁殖，引发骨髓炎。
邻近感染蔓延所致
软组织感染波及： 邻近骨骼的软组织发生感染，如脓性指头炎等，如果没有得到及时有效的治疗，感染可能会向周围的骨骼蔓延，从而引发骨髓炎。比如脓性指头炎持续加重，感染就有可能扩散到指骨，导致指骨骨髓炎。骨骼附近器官感染影响： 像脊柱附近的脏器感染，如肾盂肾炎等，感染也可能蔓延到脊柱骨骼，引发脊柱骨髓炎。例如肾盂肾炎长期不愈，炎症可能会波及脊柱周围组织，进而侵犯脊柱骨骼。