室间隔缺损的临床表现与缺损大小有关。小型室间隔缺损可能没有明显症状，中型或大型室间隔缺损时，患儿可能在出生后数月出现呼吸急促，每分钟呼吸次数可能超过40次，还可能喂养困难，体重增长缓慢。
症状表现因缺损大小而异
小型室间隔缺损： 很多患儿在婴儿期可能没有明显症状，仅在体检时发现心脏杂音。这类患儿生长发育多不受影响，一般能像正常孩子一样活动和生活，但仍需定期复查心脏情况。中型室间隔缺损： 患儿可能会出现乏力、多汗的情况，在活动后更容易气促。随着病情发展，可能影响生长发育，体重增长速度比同龄正常儿童慢。大型室间隔缺损： 新生儿时期就可能出现症状，如呼吸急促、喂养困难，体重不增。患儿还容易反复发生呼吸道感染，一年可能会有数次肺炎发作。随着年龄增长，可能出现心力衰竭的表现，如水肿，尤其是下肢水肿，肝脏也可能肿大。
不同年龄段的表现特点
婴儿期： 大型室间隔缺损的婴儿，出生后不久就可能出现呼吸急促，每分钟可达60 - 80次，同时吸吮奶时很费力，吃几口就需要休息一下，体重增长缓慢，可能低于同月龄正常婴儿。幼儿期： 中型或大型室间隔缺损的幼儿，活动耐力明显不如正常孩子，跑一段路就会蹲下休息，医学上称为蹲踞现象，这是为了减轻心脏负担。而且幼儿可能反复感冒，感冒后咳嗽、气促的症状比正常孩子更严重。儿童期： 较大儿童的室间隔缺损，如果没有得到及时治疗，可能会出现心脏增大，影响心脏功能，导致活动后心慌、气短，甚至出现声音嘶哑等情况，因为扩大的心脏可能压迫喉返神经。
伴随症状情况
部分室间隔缺损患儿可能伴有其他先天性心脏畸形，如同时存在房间隔缺损等。此时除了室间隔缺损的相关表现外，还会有相应合并畸形的表现。例如合并动脉导管未闭时，可能会出现差异性发绀，即下半身皮肤青紫，而上肢皮肤颜色相对正常。如果室间隔缺损引起肺动脉高压，还可能出现口唇、指甲发紫等缺氧表现。