肝内胆管结石症状的三大表现主要有腹痛、黄疸、发热等。其中腹痛较为常见，约有70% - 80%的患者会出现右上腹或上腹部隐痛、胀痛或绞痛。
表现一：腹痛
疼痛部位： 多位于右上腹或上腹部，疼痛性质多样，可为隐痛、胀痛，也可能是绞痛。隐痛往往是一种持续时间较长、程度相对较轻的不适感；胀痛则感觉腹部有胀满的异样；而绞痛通常比较剧烈，像被东西拧着一样。比如有的患者会感觉右上腹隐隐作痛，持续一段时间后可能会加重转变为胀痛，严重时就如同绞痛般难以忍受。疼痛诱因： 进食油腻食物后容易诱发腹痛，这是因为油腻食物会刺激胆囊收缩，而肝内胆管结石可能会影响胆汁的正常排出，从而引发疼痛。
表现二：黄疸
黄疸表现： 部分患者会出现皮肤和巩膜黄染，也就是看起来皮肤发黄，眼睛的白眼球部分也变黄。这是由于胆管结石阻塞胆管，胆汁排出受阻，胆红素反流入血，导致血液中胆红素浓度升高，从而出现黄疸症状。黄疸程度： 黄疸的程度有轻有重，轻度黄疸可能只是皮肤稍微有点发黄，不仔细看不太容易发现；重度黄疸则皮肤发黄明显，甚至尿液也会颜色加深，像浓茶一样。
表现三：发热
发热情况： 当肝内胆管结石引起胆道感染时，患者往往会出现发热症状。体温可能会升高，一般在38℃ - 39℃左右，有的患者体温甚至会更高。发热特点： 这种发热通常是间歇性的，可能上午体温正常，下午就出现发热，或者发热后又会自行消退，但容易反复。比如患者可能先出现寒战，然后体温升高，接着又慢慢降下来，但过一段时间又会再次发热。