玫瑰糠疹的病因目前尚未完全明确，但一般认为与病毒感染有一定关系，比如人类疱疹病毒6型、7型感染可能与之相关。有研究显示，约有部分患者在发病前有上呼吸道感染病史。
病毒感染因素
人类疱疹病毒6型： 研究发现，玫瑰糠疹患者血清中人类疱疹病毒6型的抗体阳性率明显高于健康人群，这提示人类疱疹病毒6型感染可能是引发玫瑰糠疹的一个重要原因。人类疱疹病毒7型： 同样，人类疱疹病毒7型感染也被怀疑与玫瑰糠疹的发生有关，不过具体的作用机制还在进一步研究中。
免疫因素
细胞免疫参与： 玫瑰糠疹患者的免疫系统会有一定的变化，细胞免疫在其中起到一定作用。患者皮肤病变部位会有淋巴细胞浸润，这些免疫细胞的异常活化可能参与了玫瑰糠疹的发病过程。体液免疫变化： 部分患者体内的体液免疫也会出现改变，比如血清中某些抗体的水平会发生变化，但具体的抗体变化与玫瑰糠疹发病的关联还需要更深入的研究来明确。
遗传因素
遗传易感性： 有一定的遗传倾向，如果家族中有玫瑰糠疹患者，那么其他家族成员患病的风险可能会相对增高。不过遗传因素并不是单独导致玫瑰糠疹发病的唯一原因，通常是在遗传易感性的基础上，结合其他因素才会发病。
其他可能因素
环境因素： 一些环境因素也可能对玫瑰糠疹的发病有影响，比如气候的变化，在季节更替时，尤其是春秋季节，玫瑰糠疹的发病率可能会有所升高；还有生活环境中的某些化学物质接触等，但这些因素的作用相对比较复杂，还需要更多的证据来证实。