脐疝主要是由于肚脐部位的腹壁组织发育不完善或存在薄弱点导致的。新生儿中，约有20%的早产儿会出现脐疝，尤其是低体重早产儿发生概率更高。
先天发育因素
胎儿时期： 在胎儿发育过程中，肚脐部位的腹壁肌肉和筋膜没有完全闭合，就容易形成脐疝的潜在基础。正常情况下，胎儿在发育到一定阶段，腹壁会逐渐闭合，但如果发育过程出现异常，就会留下薄弱区域。婴儿阶段： 对于婴幼儿来说，肚脐部位的脐环要在出生后1 - 2岁左右才会逐渐闭合。在闭合之前，如果婴儿哭闹、咳嗽等导致腹腔内压力升高，就容易使腹腔内容物通过薄弱的脐环突出形成脐疝。
腹腔内压力增高相关因素
哭闹频繁： 婴儿时期，宝宝经常哭闹是比较常见的情况。当宝宝剧烈哭闹时，腹腔内压力会明显升高，这就增加了腹腔内容物向外突出的力量，使得原本就有薄弱点的肚脐部位更容易出现脐疝。据统计，经常哭闹的婴儿发生脐疝的概率比哭闹少的婴儿要高约30%。便秘： 婴儿如果发生便秘，排便时需要用力屏气，这也会导致腹腔内压力升高。长期便秘的婴儿，腹腔内压力反复增高，也会增加脐疝发生的风险。比如有些婴儿好几天才排一次便，排便时很用力，就容易引发脐疝。
其他因素
肥胖人群： 成年人中，肥胖者也是脐疝的高发人群。肥胖会使腹部脂肪堆积，腹腔内压力增大，同时腹壁承受的压力也增加，原本正常的腹壁结构在这种情况下容易出现薄弱环节，从而导致脐疝。一般体重指数（BMI）超过30的肥胖人群，患脐疝的风险比正常体重人群高2 - 3倍。腹部手术史： 曾经做过腹部手术的人，手术切口部位可能会影响腹壁的完整性。如果手术切口愈合不良或者形成瘢痕，就可能导致腹壁出现薄弱区域，当腹腔内压力升高时，比如咳嗽、搬运重物等，就容易引发脐疝。