间质性肺炎的病因较为复杂，可能由多种因素引起。一般来说，约有70%的间质性肺炎病因尚不明确，而已知的相关因素包括环境因素、自身免疫性疾病以及某些药物等。
环境因素引起
职业环境接触： 长期处于某些特定职业环境中，可能会接触到有害颗粒或气体从而引发间质性肺炎。比如在矿山工作的人群，长期吸入粉尘，就增加了患间质性肺炎的风险。一些从事化工行业的人员，接触到某些化学物质，也可能对肺部造成损害，进而引发间质性肺炎。室内环境因素： 长期暴露在被污染的室内环境中也可能有影响。例如室内装修材料释放的甲醛等有害气体，长期吸入可能会损伤肺部组织，导致间质性肺炎的发生。还有长期生活在空气污染严重的地区，空气中的污染物会对肺部造成慢性损伤，增加间质性肺炎的发病几率。
自身免疫性疾病相关
类风湿关节炎相关： 约有10% - 20%的类风湿关节炎患者会并发间质性肺炎。类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病，免疫系统错误地攻击自身组织，除了累及关节外，还可能累及肺部，引发间质性肺炎。患者会出现咳嗽、气短等症状，随着病情进展，肺部病变可能逐渐加重。系统性红斑狼疮相关： 系统性红斑狼疮患者也有一定概率出现间质性肺炎。自身免疫系统紊乱，产生的自身抗体等物质会影响肺部组织，导致间质性肺炎的发生。患者除了有红斑狼疮的典型表现外，还会出现肺部受累的症状，如呼吸困难等。
药物因素导致
部分化疗药物： 一些用于治疗癌症的化疗药物可能会引起间质性肺炎。例如博来霉素，在使用博来霉素进行化疗的患者中，约有1% - 10%会出现间质性肺炎的不良反应。博来霉素导致间质性肺炎的机制可能与药物引起肺部的炎症反应有关，患者在用药过程中如果出现咳嗽、气短等症状，需要警惕间质性肺炎的可能。某些抗生素： 个别抗生素也可能引发间质性肺炎。比如胺碘酮，在长期服用胺碘酮的患者中，有少数人会出现间质性肺炎。胺碘酮引起肺部病变的机制尚不完全清楚，可能与药物在肺部的蓄积以及引起的炎症反应有关。