间质性肺炎的病因较为复杂，可能由多种因素引起。比如一些自身免疫性疾病就可能引发间质性肺炎，约有20% - 30%的特发性肺纤维化与自身免疫相关。
一、环境因素引起
职业环境暴露： 长期处于粉尘环境中，像煤矿工人长期吸入煤矿粉尘，农民长期接触霉变的干草等，都可能引发间质性肺炎。据统计，长期接触石棉的人群，患间质性肺炎的风险比普通人群高很多，石棉纤维会损伤肺部组织，导致肺部出现炎症反应，逐渐发展为间质性肺炎。室内环境因素： 室内装修材料释放的甲醛等有害气体，长期处于这样的环境中也可能对肺部造成损害，引发间质性肺炎。例如新装修的房屋如果通风不良，甲醛等有害物质浓度过高，就会刺激呼吸道和肺部，增加间质性肺炎的发病几率。
二、感染因素引起
病毒感染： 某些病毒感染可引发间质性肺炎，如腺病毒、流感病毒等。其中，腺病毒感染儿童较为常见，儿童感染腺病毒后，可能出现发热、咳嗽等症状，若治疗不及时，病情进一步发展就可能导致间质性肺炎。细菌感染： 一些细菌感染也可能诱发间质性肺炎，比如肺炎链球菌感染。当人体免疫力下降时，肺炎链球菌容易入侵肺部，引发肺部炎症，炎症持续发展可能影响到肺部间质，导致间质性肺炎的发生。
三、药物因素引起
某些西药： 一些药物在使用过程中可能会引起间质性肺炎的不良反应，如胺碘酮。长期服用胺碘酮的患者，约有5% - 15%会出现肺部不良反应，表现为间质性肺炎，出现咳嗽、呼吸困难等症状。中药因素： 某些中药使用不当也可能对肺部造成损害，引发间质性肺炎。不过相对西药来说，中药引起间质性肺炎的情况较少，但也不能忽视，比如个别具有肾毒性或肺毒性的中药，如果长期大量使用，也可能间接影响肺部，导致间质性肺炎的发生。