间质性肺炎的病因较为复杂，可能由多种因素引起。比如，约15%的特发性间质性肺炎患者有家族遗传倾向。而感染因素也是常见原因之一，像病毒感染，如流感病毒、巨细胞病毒等感染，有可能引发间质性肺炎。还有一些药物也可能导致间质性肺炎，约有10%左右的药物性肺损伤表现为间质性肺炎，常见的如胺碘酮、博来霉素等药物。
感染因素相关
病毒感染： 像流感病毒，它可以侵犯肺部组织，引发炎症反应，进而导致间质性肺炎。当人体免疫力低下时，更容易受到流感病毒的侵袭而诱发该病。巨细胞病毒感染也是如此，它会在肺部持续繁殖，引起肺部间质的炎症改变。细菌感染： 某些细菌感染也可能引发间质性肺炎，比如肺炎链球菌感染。当细菌进入肺部后，会刺激肺部间质组织，导致间质出现炎症细胞浸润等病理改变，从而引发间质性肺炎。
自身免疫性因素相关
类风湿关节炎相关： 约有10% - 20%的类风湿关节炎患者会并发间质性肺炎。类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病，自身免疫系统错误地攻击关节等组织，同时也可能累及肺部间质，导致间质发生炎症、纤维化等病变。系统性红斑狼疮相关： 系统性红斑狼疮患者中，也有一定比例会出现间质性肺炎。自身免疫紊乱使得体内产生的自身抗体攻击肺部间质组织，引起间质炎症，影响肺部的正常功能。
环境因素相关
职业环境： 长期接触某些职业性粉尘，就容易引发间质性肺炎。比如在矿山开采行业，长期吸入粉尘，这些粉尘会沉积在肺部间质中，刺激间质组织，导致炎症反应，久而久之可能发展为间质性肺炎。还有在化学工业中接触某些化学物质的工人，也面临着较高的间质性肺炎发病风险。家居环境： 长期处于污染的家居环境中也可能有影响。比如室内装修材料释放的甲醛等有害物质，长期吸入后可能会对肺部间质产生不良影响，增加间质性肺炎的发病几率。