新生儿黄疸是因新生儿体内胆红素代谢出现异常导致血清胆红素水平升高，从而使皮肤、黏膜和巩膜发黄的现象。大约60%的足月儿和80%的早产儿在出生后会出现生理性黄疸，一般在出生后2-3天出现，4-5天达到高峰。
胆红素生成过多
红细胞数量多且寿命短： 新生儿时期红细胞数量比成人多，且红细胞寿命较短，大约70-90天，而成人红细胞寿命约120天，所以胆红素生成相对较多。血红素加氧酶含量高： 新生儿体内血红素加氧酶含量比成人高，这种酶能促进血红素分解为胆红素，进一步增加了胆红素的产生量。
肝脏胆红素代谢障碍
肝细胞摄取胆红素能力不足： 新生儿出生后，肝细胞内Y、Z蛋白含量较低，这两种蛋白是负责摄取胆红素的，所以摄取胆红素的能力相对较弱。肝脏结合胆红素功能差： 新生儿肝脏内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UDPGT）含量低且活性不足，该酶是将未结合胆红素转化为结合胆红素的关键酶，所以结合胆红素的能力较差。
胆汁排泄障碍
胆道排泄功能不完善： 新生儿的胆道排泄系统还未完全发育成熟，可能会出现胆汁排泄不畅的情况，导致结合胆红素排泄受阻，从而使胆红素在体内堆积。肠道菌群未完全建立： 新生儿出生后肠道菌群尚未完全建立，正常情况下肠道菌群可以参与胆红素的肠肝循环，帮助胆红素排出体外，菌群未建立会影响胆红素的正常排泄。