导致肾阳虚的原因较多，其中最常见的包括先天禀赋不足，比如有些人群一出生就存在肾阳亏虚的体质基础，这可能与家族遗传等因素有关。另外，年高肾亏也是一个重要原因，随着年龄增长，人体的肾气自然衰退，一般人到了40岁以后，肾阳就会逐渐减弱，60岁以上人群肾阳虚的发生率相对会更高一些。
久病伤肾方面
慢性疾病影响： 像一些慢性肾病，病程较长，会不断损耗肾阳。例如慢性肾小球肾炎患者，长期患病会导致肾脏功能受损，进而影响肾阳的功能。还有慢性心力衰竭的病人，病情迁延不愈，也会累及肾阳，因为心阳和肾阳相互关联，心阳不足会影响肾阳的温煦功能。久病用药不当： 长期服用一些苦寒性质的药物也可能损伤肾阳。比如某些治疗热病的中药方剂中，如果苦寒药物使用过多、时间过长，就会耗伤人体阳气，其中也包括肾阳。
外邪侵袭角度
寒邪直中： 长时间处于寒冷潮湿的环境中，寒邪容易侵袭人体，直中肾脏，损伤肾阳。比如在寒冷的冬天，不注意保暖，长时间在室外劳作，寒邪就可能侵犯肾脏，导致肾阳亏虚。湿邪困阻： 湿邪为患时，也常常会伤及肾阳。湿邪黏腻重浊，容易阻碍阳气的运行，而肾阳的温化功能也会受到影响。例如一些长期居住在潮湿南方地区的人，体内湿邪较重，时间久了就容易出现肾阳虚的情况，表现为身体沉重、畏寒怕冷等症状。