肾阳虚多是由多种因素长期作用导致，比如年龄方面，随着年龄增长，人体的肾气自然衰退，一般40岁以后人群肾阳虚的发生率相对会有所增加。另外，久病伤肾也是常见原因，一些慢性疾病长期不愈，会损伤肾脏阳气，像患有慢性肾炎、糖尿病等慢性病，若病情控制不佳，病程较长时就容易出现肾阳虚。
先天禀赋不足
遗传因素影响： 如果父母体质较弱，存在肾阳虚的情况，那么子女先天禀赋可能就相对不足，更容易出现肾阳虚。比如家族中有多人有畏寒怕冷、腰膝酸软等肾阳虚表现，后代患肾阳虚的几率会比正常人群高一些。早产或体弱： 早产儿身体各方面机能发育不完善，相对正常足月儿更易出现肾阳亏虚的状况，出生后若调养不当，就容易逐渐发展为肾阳虚。
外邪侵袭
寒邪侵袭： 长期处于寒冷潮湿的环境中，寒邪容易入侵人体，损伤肾阳。例如在冬季不注意保暖，长时间待在寒冷的室外工作或生活，寒邪侵袭肌表，进而内侵肾脏，影响肾阳的功能。一般连续受寒超过两周，就可能对肾阳产生明显影响。湿邪困阻： 湿邪重浊黏腻，容易阻滞阳气运行，若人体长时间处于潮湿环境，湿邪困脾，进而影响肾阳的温煦功能。像南方一些梅雨季节较长的地区，当地居民患肾阳虚的比例相对会高一些，长期处于潮湿环境超过一个月，就可能因湿邪困阻引发肾阳不足。
房劳过度
性生活不节： 性生活过于频繁会耗伤肾阳。正常成年人如果每周性生活超过3次，且持续超过半年，就可能出现肾阳亏虚的表现，比如出现腰膝酸软、畏寒怕冷等症状。长期过度手淫也属于房劳过度范畴，同样会损伤肾阳，青少年时期频繁手淫，会影响身体正常发育，导致肾阳受损。