肛周脓肿主要是由肛腺感染引起的，大约90%的肛周脓肿是因肛腺阻塞感染所致。
肛腺感染引发
肛腺位置特点： 肛腺位于肛管直肠周围，开口于肛窦，而肛窦容易存留粪便等异物，一旦发生感染，炎症就容易向周围组织蔓延，从而引发肛周脓肿。比如，当人们进食辛辣刺激性食物后，可能会导致肛窦充血，更容易引发肛腺感染。细菌感染因素： 常见的引起肛腺感染的细菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等。这些细菌在肛窦处繁殖，进而侵入肛腺，引起肛腺炎，若炎症得不到有效控制，就会向周围的肛周组织扩散，形成脓肿。
免疫力低下导致
儿童群体： 儿童的免疫系统尚不完善，相对更容易受到细菌等病原体的侵袭。比如，有些儿童平时不注意肛门周围的清洁卫生，就可能增加肛周脓肿的发病风险。一般来说，3 - 10岁的儿童是肛周脓肿的高发人群之一。免疫力低下的成人： 患有糖尿病等基础疾病的成人，由于自身免疫力下降，身体对抗细菌感染的能力减弱。例如，糖尿病患者血糖控制不佳时，白细胞的杀菌功能会受到影响，使得细菌更容易在肛周部位滋生，引发肛周脓肿。
肛门局部损伤引发
外伤因素： 肛门部位受到外伤，如异物损伤、粗暴的肛门指诊等，都可能导致肛门周围组织受损，从而为细菌入侵创造条件。比如，在进行肛门检查时，如果操作不当，就可能损伤肛门周围组织，增加肛周脓肿的发生几率。肛门手术并发症： 进行肛门部位手术时，若手术操作不规范或术后护理不当，也可能引发肛周脓肿。例如，肛瘘手术过程中，如果对肛腺等组织处理不当，就有可能导致感染扩散，形成肛周脓肿。