消化性溃疡特征性的临床表现主要是慢性、周期性、节律性的上腹部疼痛。一般来说，十二指肠溃疡多表现为空腹痛，即餐后2-4小时开始出现疼痛，进食后缓解，疼痛具有一定的节律性，这种疼痛可能会持续数周，然后缓解一段时间后又复发，呈现出周期性发作的特点；而胃溃疡多为餐后痛，进食后0.5-1小时开始出现疼痛，1-2小时后逐渐缓解。
疼痛的节律特点
十二指肠溃疡的疼痛节律： 典型的十二指肠溃疡疼痛常发生在空腹时，也就是餐后2-4小时左右，疼痛性质多为钝痛、胀痛或灼痛等。比如有的患者可能会在午餐后2-4小时开始感觉上腹部疼痛，进食少量食物或者服用抗酸药物后疼痛可以缓解。而且这种疼痛往往会呈现出周期性，发作期可为数周，缓解期也长短不一，有的可能几周，有的可能数月。胃溃疡的疼痛节律： 胃溃疡的疼痛多在进食后出现，大约进食后0.5-1小时开始疼痛，之后会逐渐缓解，等到下一次进食后又重复这个过程。疼痛的程度和性质与十二指肠溃疡类似，也可能是钝痛等，但节律不同。
疼痛的部位
十二指肠溃疡疼痛部位： 疼痛部位多在上腹部偏右，比如剑突下偏右的位置。不过疼痛的定位可能不是特别精确，有的患者可能感觉上腹部偏右有隐痛或者胀痛等不适。胃溃疡疼痛部位： 胃溃疡的疼痛部位多在中上腹部，也就是剑突下正中或偏左的位置。同样，疼痛定位也不是绝对精确，部分患者会在此区域感觉到疼痛。
伴随症状表现
消化不良症状： 除了疼痛外，消化性溃疡患者还可能伴有消化不良的表现，比如反酸、嗳气。反酸是指胃内酸性内容物反流至食管，患者会感觉到胸骨后有灼热感以及口腔中有酸味；嗳气则是胃内气体反流至口腔，表现为不断打嗝。一般来说，约有半数以上的消化性溃疡患者会出现反酸、嗳气等消化不良症状。其他不适： 有的患者可能会出现恶心、呕吐等症状。如果溃疡比较严重，发生了出血，还可能出现黑便，严重出血时甚至会有呕血的表现；如果溃疡发生穿孔，会出现突发的剧烈腹痛，疼痛迅速波及全腹等紧急情况。