大拇指指甲盖凹凸不平可能是由以下原因引起的：
1.营养不良：缺乏维生素、矿物质或蛋白质等营养物质可能导致指甲营养不良，出现凹凸不平的情况。
2.真菌感染：指甲受到真菌感染，如灰指甲，可能导致指甲变形、增厚和凹凸不平。
3.外伤：指甲受到外力撞击、挤压或切割等损伤，可能导致指甲下淤血、变形和凹凸不平。
4.疾病：某些疾病，如银屑病、扁平苔藓、湿疹等，可能影响指甲的生长和健康，导致指甲凹凸不平。
5.遗传因素：有些人可能天生指甲比较脆弱或容易出现凹凸不平的情况。
6.频繁美甲：频繁使用指甲油、卸甲油或过度打磨指甲，可能损害指甲的表面和结构，导致指甲凹凸不平。
如果发现大拇指指甲盖凹凸不平，建议采取以下措施：
1.保持指甲清洁，避免感染。
2.注意营养均衡，摄入足够的维生素、矿物质和蛋白质。
3.避免频繁美甲，尽量减少对指甲的损伤。
4.如果指甲伴有其他症状，如变色、疼痛、肿胀等，应及时就医，进行进一步的检查和治疗。
5.对于真菌感染引起的指甲问题，医生可能会开具抗真菌药物进行治疗。
需要注意的是，指甲的变化可能是多种健康问题的信号，如果问题持续存在或加重，建议咨询专业的皮肤科医生或医生进行详细的诊断和治疗。此外，保持良好的指甲护理习惯和健康的生活方式对于维持指甲的健康也非常重要。