两岁宝宝夜里咳嗽厉害可通过以下方式处理：药物治疗、增加饮水、湿化空气等。需先判断宝宝病情，若在感冒恢复期遗留咳嗽且夜间明显，可先居家观察，但若宝宝出现发热、咳痰且症状加重等情况，则可能病情有变化，应及时找儿科医生就诊治疗。
一、药物治疗
1.夜间迷走神经兴奋性增高，平躺姿势易刺激咳嗽，所以夜间咳嗽一般比白天严重。若是肺炎等情况，咳嗽好转需一定时间，可继续遵医嘱使用抗生素治疗。咳嗽严重时可用雾化吸入治疗来改善。
2.2岁宝宝应谨慎使用止咳药或其他祛痰药。
二、增加饮水
1.增加饮水量可湿化气道，稀释痰液，利于痰液排出，从而改善咳嗽症状。
2.2岁宝宝也可吃点蜂蜜或蜂蜜水来改善咳嗽情况。
三、湿化空气
使用加湿器将室内湿度增加到50-60%，能湿化气道，进而改善咳嗽症状。
总之，当两岁宝宝夜里咳嗽厉害时，要根据具体情况采取合适的处理方法，密切关注宝宝状态，必要时及时就医。