肝癌的检查方法有多种，比如血清学检查，其中甲胎蛋白（AFP）是常用的指标，约70%的肝癌患者AFP会升高，但也有部分患者AFP不升高。一般来说，通过血液检测AFP等指标可以初步筛查肝癌。
影像学检查
超声检查： 是肝癌筛查的常用方法，价格相对便宜，操作简便，能发现直径1厘米左右的肝脏占位。它可以清晰显示肝脏的形态、结构以及病灶的位置、大小等情况。CT检查： 能够更精确地显示肝癌的大小、数目、形态以及与血管的关系等。增强CT还可以通过对比剂的增强效果，更清楚地鉴别肝癌与其他肝脏占位性病变，一般在超声发现问题后进一步明确诊断时会选择CT检查。磁共振成像（MRI）： 对肝癌的诊断价值与CT相似，但在某些方面可能更具优势，比如对肝癌子灶的发现以及与肝血管瘤等的鉴别诊断上有更好的效果。
病理检查
肝穿刺活检： 是确诊肝癌的重要方法。在超声或CT引导下，通过穿刺针获取肝脏病变组织进行病理检查，从而明确病变是否为肝癌以及肝癌的具体病理类型等。不过这是一种有创检查，有一定的出血等风险，但对于诊断肝癌具有决定性意义。如果其他检查高度怀疑肝癌，但又不能完全确诊时，可能会考虑进行肝穿刺活检。
其他检查
PET - CT检查： 对于发现肝癌的远处转移等情况有帮助。它可以通过检测体内代谢活跃的区域来判断是否有肝癌的转移病灶，但相对费用较高，一般不是首选的初筛检查方法，多用于肝癌分期等情况的评估。