三个多月宝宝睡觉头摇来摇去可能与以下因素有关，家长可根据具体情况进行相应处理：
一、环境：如果宝宝睡觉时环境温度较高，易导致出汗多，进而出现睡觉时头摇来摇去的情况。对此，家长可以通过使用加湿器来调节室内湿度，改善温度状况，还可以给宝宝更换薄一些的被子，以缓解这种现象。
二、湿疹：湿疹会引发皮肤瘙痒，当宝宝头部有湿疹时，可能会因瘙痒而睡觉时头摇来摇去。家长通常可以在医生指导下，给宝宝使用如炉甘石洗剂、氧化锌软膏、丁酸氢化可的松乳膏等药物进行治疗。
三、维生素D缺乏症：这是一种全身慢性、营养性疾病，常伴有多汗、睡眠不安等表现，所以宝宝睡觉头摇来摇去可能与之有关。家长可在医生指导下，给宝宝使用碳酸钙颗粒、葡萄糖酸钙颗粒、乳酸钙颗粒等药物进行治疗，同时也可适当增加宝宝的日照时间，这有利于补钙，促进宝宝骨骼发育。
总之，当发现三个多月宝宝睡觉时头摇来摇去，家长要仔细观察并分析原因，采取相应的措施，若情况持续不改善或伴有其他异常症状，应及时就医。