三个月宝宝睡觉老是摇头，可能是正常的生理现象，也可能与维生素D缺乏、湿疹等原因有关。
正常的生理现象：宝宝的前庭功能发育不完善，会出现摇头、摇晃身体等动作，这是正常的生理现象，通常会随着宝宝的生长发育逐渐消失。
维生素D缺乏：宝宝体内维生素D不足，会导致钙吸收不良，引起神经兴奋性增高，出现多汗、摇头、烦躁、睡眠不安等症状。
湿疹：宝宝头部、面部、颈部等部位出现湿疹，会导致皮肤瘙痒，宝宝会通过摇头来缓解瘙痒。
其他：中耳炎、外耳道炎等耳部疾病，也会导致宝宝出现摇头的症状。
需要注意的是，如果宝宝除了摇头，还伴有其他异常症状，如哭闹、烦躁、睡眠不安、夜惊、枕秃等，可能是疾病引起的，需要及时就医，明确原因。
此外，在日常生活中，家长要注意给宝宝补充维生素D，多晒太阳，保持皮肤清洁干燥，避免宝宝长时间处于过热的环境中。如果宝宝出现湿疹，要及时就医，遵医嘱使用药物治疗。同时，要注意观察宝宝的情况，如果宝宝的症状持续不缓解或加重，应及时就医。