再生障碍性贫血的原因较为复杂，可能与多种因素有关。据相关医学研究，约半数以上的再生障碍性贫血患者病因不明确，称为原发性再生障碍性贫血；而能明确病因的则称为继发性再生障碍性贫血，常见的原因如下：
一、药物因素
抗肿瘤药物： 一些细胞毒性抗肿瘤药物，如氯霉素、甲氨蝶呤、环磷酰胺等，可能会引起再生障碍性贫血。有研究发现，长期或大剂量使用某些抗肿瘤药物后，发生再生障碍性贫血的风险会增加。例如，部分白血病患者在化疗过程中，可能出现骨髓抑制，进而发展为再生障碍性贫血。解热镇痛药物： 像保泰松、阿司匹林等非甾体类解热镇痛药物也可能与再生障碍性贫血的发生相关。其中，保泰松引起再生障碍性贫血的报道相对较多，其机制可能与药物抑制骨髓造血干细胞的增殖有关。
二、化学毒物因素
苯及其衍生物： 长期接触苯是导致再生障碍性贫血的重要危险因素。苯在工业上应用广泛，如油漆、橡胶、染料等行业的工人，如果长期处于苯污染的环境中，苯及其代谢产物可抑制骨髓造血干细胞的分化和增殖，损害骨髓造血微环境，从而引发再生障碍性贫血。据统计，长期接触苯的人群患再生障碍性贫血的几率比普通人群高数十倍。农药： 某些农药，如有机磷农药等，也可能对骨髓造血功能产生不良影响。长期接触农药的农民等人群，发生再生障碍性贫血的风险有所升高，但其具体的致病机制还在进一步研究中。
三、病毒感染因素
肝炎病毒： 肝炎病毒感染与再生障碍性贫血的关系较为密切。特别是丙型肝炎病毒（HCV）感染，有报道显示，部分丙型肝炎患者在病程中会出现再生障碍性贫血的并发症。肝炎病毒可能通过直接抑制骨髓造血干细胞、损伤骨髓微环境或引发自身免疫反应等多种途径影响造血功能。例如，一些慢性丙型肝炎患者，在疾病进展过程中，逐渐出现全血细胞减少，符合再生障碍性贫血的表现。微小病毒B19： 感染微小病毒B19也可能导致再生障碍性贫血。该病毒主要侵犯骨髓中的红系造血祖细胞，抑制其增殖，从而影响红细胞的生成，严重时可累及全血细胞，引发再生障碍性贫血。在一些免疫力低下的人群中，如艾滋病患者、接受免疫抑制治疗的患者等，感染微小病毒B19后发生再生障碍性贫血的风险相对较高。