卵巢多囊症的病因目前尚未完全明确，一般认为可能与遗传因素、内分泌失调以及生活方式等多种因素有关。有研究表明，约60%~70%的卵巢多囊症患者存在遗传易感性。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有卵巢多囊症，那么女性成员患病的风险会相对增加。比如，母亲患有卵巢多囊症，其女儿患病的几率比正常人群要高很多。研究发现，卵巢多囊症是一种具有遗传异质性的疾病，多个基因可能与该病的发生相关，这些基因会影响内分泌调节等多个环节，从而增加患病风险。
内分泌失调因素
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节紊乱： 正常情况下，下丘脑会分泌促性腺激素释放激素，刺激垂体分泌促卵泡生成素和促黄体生成素，来调节卵巢的功能。而在卵巢多囊症患者中，下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴出现紊乱，促黄体生成素分泌相对增多，促卵泡生成素分泌相对不足，导致卵巢内卵泡发育异常，不能正常排卵，进而引起一系列激素水平的改变，如雄激素水平升高、雌激素相对失衡等。例如，患者可能会出现高雄激素血症，表现为多毛、痤疮等症状。胰岛素抵抗： 约50%~70%的卵巢多囊症患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多的胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症又会刺激卵巢分泌更多的雄激素，进一步加重卵巢的病变，形成恶性循环。
生活方式因素
饮食习惯： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食容易导致体重增加，而肥胖是卵巢多囊症的一个重要危险因素。比如，经常摄入过多油炸食品、甜食等，会使身体脂肪堆积，影响内分泌系统的正常功能，增加卵巢多囊症的发病几率。运动不足： 缺乏体育锻炼也是导致卵巢多囊症的一个因素。长期不运动，身体代谢率降低，容易出现肥胖等问题，进而影响内分泌调节，使得卵巢功能紊乱，增加患病风险。一般建议每周至少进行150分钟的中等强度有氧运动，如快走、慢跑等，以维持身体的正常代谢和内分泌平衡。