肾盂肾炎主要是由细菌感染引起的，绝大多数致病菌是大肠埃希菌，约占60%-80%。比如，女性尿道短而宽，距离肛门近，细菌更容易侵入尿道并上行感染到肾盂，这也是女性肾盂肾炎发病率比男性高很多的重要原因，据统计，女性肾盂肾炎发病率约为男性的10倍左右。
致病菌入侵途径
上行感染： 这是最常见的途径。细菌从尿道进入，比如不注意会阴卫生、性生活后没有及时清洁等情况，细菌沿着尿道向上蔓延，经过膀胱、输尿管，最终到达肾盂引发感染。像女性在经期，会阴局部抵抗力下降，就更容易通过上行感染患上肾盂肾炎。血行感染： 身体其他部位的感染病灶，比如皮肤感染、扁桃体炎等，细菌可通过血液循环到达肾脏引起肾盂肾炎。这种情况相对少见，一般是在机体免疫力极度低下或者有严重感染灶时才会发生。例如，患有败血症的患者，细菌随着血液流动到达肾脏，就可能引发肾盂肾炎。
易感人群特点
女性群体： 女性尿道短、宽且直，距离肛门近，这使得细菌更容易侵入。而且女性在经期、孕期、更年期等特殊时期，身体的生理状态会发生变化，也增加了肾盂肾炎的发病风险。比如孕期，增大的子宫会压迫输尿管，导致尿液引流不畅，容易滋生细菌引发感染。泌尿系统结构异常者： 比如患有尿路结石、先天性输尿管畸形等疾病的人，尿液排出受阻，尿液在泌尿系统内潴留，有利于细菌生长繁殖，从而容易诱发肾盂肾炎。像尿路结石患者，结石会阻碍尿液的正常流动，使局部细菌难以被冲刷排出，长期以往就容易引发肾盂肾炎。机体免疫力低下者： 如糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人等，他们的身体抵抗力较弱，容易受到细菌侵袭。糖尿病患者由于血糖高，有利于细菌生长，同时自身免疫力也受到影响；长期使用免疫抑制剂的人，机体的免疫防御功能被抑制，细菌就更容易在肾脏部位定植并引发感染。