急性肾盂肾炎主要是由细菌感染引起的，其中最常见的致病菌是大肠埃希菌，约占60%~80%。
感染途径之上行感染
分点标题： 细菌经尿道上行至膀胱：当人体抵抗力下降时，尿道口周围的细菌容易沿尿道上行进入膀胱，引发膀胱炎，如果细菌继续沿输尿管向上蔓延，就可能到达肾脏，引起肾盂肾炎。比如女性尿道短而宽，且靠近肛门，更容易发生上行感染，尤其是性生活后，细菌更易侵入尿道。分点标题： 细菌经血液传播：身体其他部位的感染病灶中的细菌可通过血液循环到达肾脏引起肾盂肾炎。例如皮肤感染、扁桃体炎等，细菌随着血流到达肾脏，从而引发炎症。
易感人群因素
分点标题： 女性更容易患病：女性尿道短、宽，且距离肛门近，这使得细菌更容易侵入尿道并上行感染肾脏。据统计，女性一生中患急性肾盂肾炎的概率相对较高，约为男性的10倍左右。分点标题： 泌尿系统结构或功能异常者：如患有尿路结石、多囊肾、前列腺增生等疾病的人，尿液排出不畅，细菌容易在局部滋生繁殖，从而增加了患急性肾盂肾炎的风险。比如尿路结石会阻碍尿液的正常流动，导致尿液潴留，为细菌的生长提供了有利环境。
机体抵抗力因素
分点标题： 免疫力低下人群：糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人以及老年人等，由于自身免疫力较弱，身体抵御细菌感染的能力下降，更容易受到细菌的侵袭而发生急性肾盂肾炎。例如糖尿病患者血糖控制不佳时，机体的免疫功能会受到影响，容易并发各种感染，包括肾盂肾炎。分点标题： 近期有尿道操作史人群：如进行导尿、膀胱镜检查等尿道操作时，可能会损伤尿道黏膜，破坏尿道的防御屏障，使得细菌更容易侵入泌尿系统，从而引发急性肾盂肾炎。一般在进行这类尿道操作后的短期内，患病风险会有所增加。