肾盂积水的治疗需根据病因等情况来定。对于由尿路结石引起的肾盂积水，如果结石较小，可通过大量饮水，每天保证2000 - 3000毫升的饮水量，促进小结石自行排出；如果结石较大，可能需要进行体外冲击波碎石，利用高能冲击波聚焦后作用于结石，将其击碎。
针对病因治疗
泌尿系统结石导致：如果是泌尿系统结石引发的肾盂积水，要先明确结石的大小、位置等。比如结石直径小于0.6厘米且表面光滑，无尿路梗阻等情况时，可先尝试保守治疗，让患者大量饮水，多做跳跃运动等，帮助结石排出；要是结石较大，直径大于0.6厘米，可能需要进行输尿管镜取石术或者经皮肾镜取石术等手术方式来去除结石，解除梗阻，缓解肾盂积水。泌尿系统肿瘤导致：若是泌尿系统肿瘤引起的肾盂积水，需要根据肿瘤的性质、分期等采取相应治疗。如果是良性肿瘤，可能通过手术切除肿瘤即可；如果是恶性肿瘤，往往需要综合手术、化疗、放疗等多种手段来治疗，以去除肿瘤病灶，解决肾盂积水问题。
引流治疗
肾造瘘术：当患者病情比较严重，比如存在严重感染、肾功能严重受损等情况，无法立即进行复杂手术解决病因时，可先做肾造瘘术，通过在腰部穿刺建立通道，将肾盂内的尿液引流出来，改善肾盂积水状况，为后续进一步治疗创造条件。输尿管支架置入术：如果是输尿管部位的梗阻，可通过内镜等手段置入输尿管支架，撑开梗阻部位，让尿液能够顺利通过，从而缓解肾盂积水。一般支架可放置数月，之后根据情况取出或者更换。
药物辅助治疗
控制感染药物：如果肾盂积水伴有感染，需要使用抗生素来控制感染。常用的抗生素有头孢菌素类等，根据感染的病原体类型选择合适的抗生素。比如对于常见的大肠杆菌感染，可选用头孢曲松等头孢菌素类药物进行抗感染治疗，通过抑制细菌细胞壁的合成来杀灭细菌，减轻感染症状，辅助缓解肾盂积水相关的不良状况。