长口疮的原因有多种。一般来说，约20%-30%的人群会受到复发性阿弗他溃疡（常见口疮类型）的困扰，其发病与多种因素相关。
局部创伤因素
口腔内机械刺激： 比如刷牙时用力过猛，或牙齿有锐利的边缘、残根残冠等，会反复摩擦口腔黏膜，从而引发口疮。像长期存在的尖锐牙尖，就可能持续刺激对应部位的黏膜，导致局部出现破损、溃疡。咬伤口腔黏膜： 吃饭时不小心咬到嘴唇、颊部等部位，形成的伤口如果护理不当，也容易发展成口疮。比如吃东西速度过快，就可能出现这种情况。
免疫系统因素
免疫力低下： 当人体免疫力降低时，比如患有某些慢性疾病、长期熬夜、过度劳累等情况，就容易受到病原体侵袭，进而引发口疮。像艾滋病患者由于免疫系统严重受损，口疮的发生几率就会大大增加；长期熬夜的人，身体处于应激状态，免疫力下降，也更容易长口疮。自身免疫反应异常： 部分口疮患者存在自身免疫反应异常的情况，免疫系统错误地攻击自身的口腔黏膜组织，导致黏膜受损出现溃疡。例如患有白塞病的患者，除了口疮，还可能伴有眼部、生殖器等部位的病变，这与自身免疫紊乱密切相关。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 尤其是缺乏维生素B族，像维生素B2、B6、B12等，会影响口腔黏膜的正常代谢，导致黏膜抵抗力下降，容易长口疮。比如长期挑食、偏食的人，很容易出现维生素摄入不足的情况。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素缺乏也与口疮的发生有关。锌参与人体多种酶的合成和代谢，对维持黏膜健康很重要；铁是血红蛋白的组成成分，缺乏时会影响身体的正常生理功能，进而可能引发口疮。例如孕妇如果缺乏铁元素，就可能更容易长口疮。