感染性心内膜炎治疗通常需要联合使用抗生素，一般要持续用药4~6周左右。比如急性感染性心内膜炎，多选用青霉素类联合氨基糖苷类抗生素。
抗生素选择原则
经验性用药： 在未明确病原体前，根据常见致病菌选用抗生素。例如，对于社区获得性的感染性心内膜炎，可能会经验性选用青霉素联合氨基糖苷类药物，如青霉素联合庆大霉素。针对性用药： 当通过血培养等检查明确病原体后，会根据病原体的药敏结果选择敏感抗生素。比如金黄色葡萄球菌感染，若对苯唑西林敏感，就选用苯唑西林治疗。
手术治疗情况
需手术的情况： 当出现严重并发症时需要手术。如瓣膜穿孔、破裂，导致重度心力衰竭；或者真菌性心内膜炎，药物治疗效果不佳时，多需要进行心脏瓣膜置换术或修复术。手术时机： 一般在积极抗感染治疗的同时，评估患者病情，争取在感染控制相对较好时进行手术，减少手术风险。比如感染得到一定控制，患者一般情况有所改善时。
支持治疗方面
营养支持： 患者由于疾病消耗，需要保证充足的营养摄入。可以给予高蛋白、高热量、富含维生素的饮食，必要时可通过肠内或肠外营养支持，保证患者身体有足够的能量来对抗感染。对症治疗： 对于出现心力衰竭的患者，需要进行相应的抗心力衰竭治疗，如使用利尿剂减轻心脏负荷等；对于发热的患者，可采用物理降温或适当使用退热药物来控制体温，但要注意药物对心脏等器官的影响。