上呼吸道感染主要由病毒引起，其中约70% - 80%由病毒导致，常见的病毒有鼻病毒、冠状病毒、流感病毒等；细菌感染也是引发上呼吸道感染的原因之一，约占20% - 30%，像A组溶血性链球菌、肺炎链球菌等细菌可引起感染。
病毒引发上呼吸道感染
鼻病毒： 是引发普通感冒最常见的病原体之一，它很容易在人群中传播，通过飞沫或接触被污染的物体表面传播，能引起鼻塞、流涕、咳嗽等症状。冠状病毒： 除了引发普通感冒外，某些冠状病毒如新冠病毒，可导致较为严重的呼吸道感染，不同类型的冠状病毒引起的症状有所差异，但都可能涉及上呼吸道，引发发热、乏力、咳嗽等表现。
细菌导致上呼吸道感染
A组溶血性链球菌： 常可引起扁桃体炎，患者会出现扁桃体红肿、疼痛，有的还会有发热、咽部有脓性分泌物等症状。比如在学校等人群密集场所，容易出现集体发病的情况。肺炎链球菌： 可引发肺炎、中耳炎等并发症，当它感染上呼吸道时，可能导致患者出现高热、寒战、咳嗽、咳痰等症状，严重时会影响呼吸功能。
其他诱发因素
环境因素： 长期处于拥挤、通风不良的环境中，会增加上呼吸道感染的风险。例如在密闭的教室、宿舍等空间，病毒和细菌更容易传播。免疫力低下： 儿童、老年人以及患有慢性疾病（如糖尿病、艾滋病等）的人群，免疫力相对较低，更容易受到病原体的侵袭而发生上呼吸道感染。儿童由于免疫系统尚未发育完善，相比成年人更易患病；老年人身体机能衰退，免疫力下降，也是上呼吸道感染的高发人群。