上呼吸道感染约有70%~80%由病毒引起，常见的病毒包括鼻病毒、冠状病毒、流感病毒等；细菌感染约占20%~30%，像溶血性链球菌、肺炎链球菌等是常见的致病菌。
病毒引起上呼吸道感染
鼻病毒： 鼻病毒是引发普通感冒的主要病原体之一，它很喜欢在鼻腔黏膜中“安营扎寨”，能通过飞沫传播等方式感染人体，引发鼻塞、流涕、打喷嚏等症状，每年的多个季节都可能有它的身影。冠状病毒： 有多种冠状病毒会导致上呼吸道感染，比如引起普通感冒的某些冠状病毒毒株，它传播途径主要是飞沫和接触传播，感染后可能出现咳嗽、咽痛等表现。
细菌引起上呼吸道感染
溶血性链球菌： 这种细菌常引发扁桃体炎等上呼吸道感染情况，当人体抵抗力下降时，它就容易入侵，患者会出现扁桃体红肿、疼痛，甚至有脓性分泌物等症状。肺炎链球菌： 它可导致肺炎、中耳炎等并发症相关的上呼吸道感染，一般在儿童等人群中较易感染，感染后可能出现发热、咳嗽、咳痰等症状。
其他诱发因素
环境因素： 长期处于空气污染严重的环境中，比如雾霾天气里，空气中的有害颗粒等会刺激呼吸道，降低呼吸道的防御能力，增加上呼吸道感染的风险。免疫力低下： 比如老年人、儿童以及患有慢性疾病（像糖尿病、艾滋病等）的人群，他们的身体免疫力相对较低，更容易受到病原体的侵袭而发生上呼吸道感染。当人体过度疲劳、睡眠不足时，身体的免疫力也会下降，从而容易让病毒、细菌等有可乘之机引发上呼吸道感染。