肥厚性心肌病的表现多样，常见的有呼吸困难，约半数以上患者会出现劳力性呼吸困难，一般在运动或劳累后较为明显，休息后可缓解。另外，胸痛也是常见表现之一，约1/3的患者会出现劳力性胸痛，持续时间不等，有的可能几分钟，有的则较长。
一、心脏方面的表现
心悸： 部分患者会感觉心跳异常，能明显感觉到心脏跳动，可能是由于心律失常等原因引起。比如有些患者会出现阵发性的心悸，自己能察觉到心跳加快且不规律。晕厥或近似晕厥： 约1/4的患者可能发生晕厥，多在运动时出现，是因为心肌肥厚导致流出道梗阻，影响心脏泵血，脑部供血不足引起。一般持续时间较短，数秒至数分钟可自行恢复。
二、全身症状表现
乏力： 患者常感到全身没力气，活动耐力下降。即使做一些轻微活动，也会比正常人更容易觉得累，影响日常生活和工作。多汗： 部分患者会出现多汗的情况，尤其是在运动后或夜间睡眠时。这可能与交感神经兴奋等因素有关。比如在运动后，别人可能只是微微出汗，而患者会出较多的汗。
三、晚期表现
心力衰竭： 到了疾病晚期，可能出现心力衰竭的表现，如呼吸困难加重，休息时也会出现，伴有咳嗽、咳痰，严重时可出现粉红色泡沫痰，还会有下肢水肿、腹胀、食欲减退等症状。这是因为心脏功能严重受损，无法正常泵血，导致体循环和肺循环淤血。心律失常加重： 晚期心律失常可能会更加频繁和复杂，如出现室性心动过速等严重心律失常，可进一步加重病情，甚至危及生命。