肠炎是由多种因素引起的肠道炎症，其中感染因素较为常见，比如约 90%的急性肠炎与病毒、细菌、寄生虫等感染有关。像轮状病毒可引起儿童病毒性肠炎，某些大肠杆菌感染能导致细菌性肠炎。
感染性肠炎的病因
病毒感染： 常见的有轮状病毒，它多在秋冬季节流行，主要侵袭 6 - 24 个月的婴幼儿，会引起腹泻、呕吐等症状。还有诺如病毒，可通过污染的水源、食物传播，各年龄段人群都能感染，会导致急性胃肠炎。细菌感染： 沙门氏菌是常见的致病菌，常常通过食用被污染的肉类、蛋类等食物进入人体，引发腹痛、腹泻、发热等症状。大肠杆菌中的某些菌株，如肠出血性大肠杆菌 O157:H7，会造成严重的肠道感染，出现 bloody diarrhea（血性腹泻）等症状。寄生虫感染： 溶组织内阿米巴是肠道内的寄生虫，会引起阿米巴痢疾，表现为腹痛、腹泻，大便可能带有脓血。贾第虫也是常见的肠道寄生虫，会导致腹泻、腹胀、腹痛等肠炎症状。
非感染性肠炎的病因
饮食因素： 长期食用辛辣、油腻、刺激性食物，比如经常吃麻辣烫、油炸食品等，会刺激肠道黏膜，引发肠炎。过度饮酒也会损伤肠道黏膜，导致肠道炎症。药物因素： 某些药物可能会引起肠炎，像非甾体类抗炎药，如阿司匹林、布洛芬等，长期或大量服用可能会损伤胃黏膜，进而影响肠道，引发肠炎。化疗药物在杀伤肿瘤细胞的同时，也可能对肠道黏膜造成损害，导致肠炎。自身免疫因素： 如溃疡性结肠炎，是一种自身免疫性疾病，病因尚不十分明确，可能与遗传、环境等多种因素有关，免疫系统错误地攻击肠道黏膜，导致肠道持续炎症、溃疡等病变。克罗恩病也是一种慢性炎症性肠病，属于自身免疫介导的疾病，可累及肠道的任何部位，出现腹痛、腹泻、肠梗阻等多种症状。