前列腺囊肿的形成原因主要有以下几方面。首先是先天性因素，比如中肾导管与中肾旁管发育异常，管腔部分扩张就可能形成囊肿。这种先天性的前列腺囊肿有的还会伴随尿道下裂、隐睾、肾发育不全等其他先天性疾病。其次是后天性因素，前列腺腺泡梗阻也会导致囊肿形成。前列腺腺泡上皮逐渐增厚，致使腺泡导管狭窄甚至阻塞，内容物潴留就形成囊肿。还有寄生虫性因素，比如寄生虫能引起前列腺管及周围发生慢性炎症，或者引发肉芽增生，进而形成囊肿。例如棘球蚴可使前列腺管及周围发生慢性炎症，或由肉芽增生逐渐形成囊肿。
先天性因素相关情况
中肾导管异常： 中肾导管在发育过程中如果出现异常扩张，就可能形成囊肿。这种情况往往是胚胎发育时期的问题，是先天性的结构异常导致。中肾旁管异常： 中肾旁管发育异常时，也有可能部分扩张形成前列腺囊肿，并且这类先天性囊肿有时会合并其他泌尿系统的先天性畸形，像尿道下裂等。
后天性腺泡梗阻因素
腺泡上皮增厚： 前列腺腺泡上皮会随着年龄增长或者一些病理因素影响而逐渐增厚，当增厚到一定程度时，就会使腺泡导管变得狭窄。比如一些慢性前列腺炎症等情况可能会刺激腺泡上皮增厚。导管阻塞潴留： 腺泡导管狭窄后，内容物就难以正常排出，长时间潴留就会形成囊肿。就像水管堵塞后，里面的液体越积越多形成积水一样的道理。
寄生虫性因素情况
寄生虫感染引发炎症： 当人体感染某些寄生虫，如棘球蚴时，寄生虫会引起前列腺管及周围组织发生慢性炎症反应。这种慢性炎症会影响前列腺管的正常功能，使得分泌物潴留等情况发生，进而逐渐形成囊肿。炎症导致肉芽增生： 前列腺管及周围的慢性炎症还可能引发肉芽组织增生，肉芽增生会影响前列腺内部的结构和液体的排出，最终也可能导致囊肿形成。