土茯苓与茯苓的区别在于：
1.来源不同：土茯苓是百合科植物光叶菝葜的干燥根茎；茯苓是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核。
2.功效不同：土茯苓具有解毒、除湿、通利关节的功效，主要用于治疗梅毒、汞中毒导致的肢体拘挛、筋骨疼痛、湿热淋浊、带下、痈肿、瘰疬、疥癣等；茯苓具有利水渗湿、健脾、宁心的功效，主要用于治疗水肿尿少、痰饮眩悸、脾虚食少、便溏泄泻、心神不安、惊悸失眠等。
3.用法用量不同：土茯苓的用量一般为15-60g；茯苓的用量一般为9-15g。
4.禁忌不同：土茯苓的禁忌尚不明确；茯苓的虚寒精滑或气虚下陷者忌服。