矮小症是指儿童的身高低于同性别、同年龄、同种族儿童平均身高的2个标准差（-2SD），或低于第三百分位（-1.88SD）。导致矮小症的原因有多种，常见的有以下几类：
遗传因素导致
基因缺陷： 某些单基因缺陷会影响生长激素的分泌或作用，从而导致身材矮小。比如，一些孩子携带特定的生长激素基因变异，使得身体产生生长激素的能力或对生长激素的反应出现异常。家族遗传倾向： 如果家族中有身材矮小的遗传背景，孩子发生矮小症的概率相对较高。例如，父母身高偏矮，孩子遗传到相关基因后，可能出现生长发育较迟缓的情况。
内分泌因素导致
生长激素缺乏或分泌异常： 生长激素是促进人体生长的重要激素。如果垂体分泌生长激素不足，就会影响骨骼的生长和身体的发育。比如，垂体发育异常可能导致生长激素分泌减少，使孩子的身高增长明显落后于同龄人。甲状腺功能减退： 甲状腺分泌的甲状腺激素对生长发育也起着关键作用。当孩子甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响新陈代谢和生长发育进程，导致身材矮小，同时还可能伴有智力发育迟缓等问题。
疾病因素导致
慢性疾病影响： 一些慢性疾病会消耗身体能量，影响营养的吸收和利用，从而阻碍生长发育。例如，患有先天性心脏病的孩子，长期心脏功能不佳，身体得不到充足的氧气和营养供应，会影响身高增长。骨骼疾病： 像软骨发育不全等骨骼系统的疾病，会直接影响骨骼的正常生长和发育，导致身材矮小。这类孩子的骨骼结构存在异常，使得身高明显低于正常水平。
其他因素导致
营养不均衡： 儿童时期如果长期营养不良，缺乏蛋白质、钙、磷等重要营养素，会影响骨骼的生长和身体的发育。比如，孩子挑食、偏食，导致摄入的营养不能满足生长需求，就可能出现矮小的情况。睡眠不足： 生长激素在夜间睡眠时分泌旺盛，如果孩子长期睡眠不足，会影响生长激素的分泌，进而影响身高增长。一般来说，儿童每天需要保证充足的睡眠时间，婴幼儿可能需要12 - 15小时，学龄儿童也需要9 - 12小时。