矮小症是指儿童的身高低于同性别、同年龄、同种族儿童平均身高的2个标准差（-2SD），或低于第三百分位（-1.88SD）。导致矮小症的原因有多种，以下是一些常见的因素。
遗传因素导致
基因遗传：如果父母双方身高都偏矮，孩子遗传到矮小基因的概率相对较高。比如父母身高都属于偏矮范围，那么孩子发生矮小症的风险比正常身高父母的孩子要高一些。家族遗传病史：某些遗传性疾病也会引发矮小症，像特纳综合征，这是一种只发生在女性身上的遗传性疾病，由于染色体异常，会导致身高明显低于正常同龄人。
内分泌因素导致
生长激素缺乏：生长激素是促进人体生长的重要激素，如果垂体分泌生长激素不足，就会影响孩子的生长发育，导致身材矮小。一般通过相关检查可以发现生长激素水平低于正常范围。甲状腺功能减退：甲状腺分泌的甲状腺激素对生长发育也起着关键作用，当甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会使孩子的生长速度减慢，出现矮小症的表现，同时还可能伴有智力发育迟缓等其他症状。
疾病因素导致
慢性疾病影响：一些慢性疾病会影响孩子的生长，比如先天性心脏病，孩子长期处于缺氧等状态，会影响身体的营养代谢和生长发育；还有慢性肾病，会导致体内代谢紊乱，影响生长激素的作用，从而引发矮小症。骨骼疾病所致：像软骨发育不全，这是一种先天性的骨骼发育异常疾病，会造成骨骼生长受限，导致身材矮小，孩子的四肢短小，躯干相对正常，但整体身高明显低于正常水平。
营养与生活因素导致
营养不良：孩子在成长过程中，如果长期营养不良，缺乏蛋白质、维生素、矿物质等营养物质，会影响骨骼的生长和发育。例如，长期摄入蛋白质不足，就会影响身体的生长发育所需的物质合成。缺乏运动：适当的运动有助于骨骼的生长和发育，如果孩子长期缺乏运动，也可能会影响身高的增长。运动可以刺激生长激素的分泌，促进骨骼的生长。