大便出血且肛门有疼痛感，可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开后形成的感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛门检查时可发现肛裂的创面，呈梭形或椭圆形，常因便秘或腹泻导致肛管受损而发病。
2.痔疮：内痔或混合痔均可引起大便出血，通常为鲜红色，表现为便后滴血或喷射状出血。部分患者可能伴有肛门肿物脱出、肛门瘙痒或疼痛等症状。
3.肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，如直肠癌、肛管癌等，也会导致大便出血，并伴有肛门疼痛、肛门坠胀感、大便习惯改变等症状。
4.肠道炎症性疾病：如溃疡性结肠炎、克罗恩病等，可导致肠道黏膜炎症、溃疡形成，从而引起大便出血和肛门疼痛。
5.肛门部损伤：如肛裂、肛管或直肠的手术、外伤等，可导致肛门部疼痛和出血。
6.其他：如缺血性肠病、肠息肉、肛瘘等，也可能出现类似症状。
如果出现大便出血和肛门疼痛，建议及时就医，进行详细的检查，如肛门指诊、肛门镜检查、结肠镜检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，在就医前应注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，保持大便通畅。