女生肾盂肾炎主要是由细菌感染引起的，其中大肠埃希菌是最常见的致病菌，约占60%~80%。
感染途径：上行感染为主
膀胱到肾盂的上行： 女性尿道短而宽，长度约3~5厘米，细菌容易从尿道外口进入，然后向上蔓延至膀胱，再经输尿管到达肾盂引起感染。比如，性生活后就容易增加细菌上行感染的机会。血行感染： 较少见，当身体其他部位有感染病灶，细菌可通过血液循环到达肾脏引起肾盂肾炎。例如，皮肤感染、扁桃体炎等病灶中的细菌，可能随着血流到达肾脏。
易感因素：女性自身特点相关
生理结构因素： 女性尿道短、直且靠近肛门，肛门周围的细菌容易侵入尿道。据统计，女性一生中患肾盂肾炎的概率相对较高，尤其是育龄女性。尿路梗阻： 如尿路结石、先天性尿路畸形等，会阻碍尿液正常排出，使尿液在尿路中潴留，细菌容易繁殖引发感染。比如尿路结石患者，尿液排出不畅，就更容易发生肾盂肾炎。机体免疫力下降： 当女生劳累、患有糖尿病等基础疾病时，机体免疫力降低，抵御细菌的能力减弱，容易发生肾盂肾炎。比如长期熬夜劳累后，身体抵抗力下降，就可能给细菌可乘之机。
其他相关情况：导尿等医源性因素
导尿操作： 进行导尿等侵入性操作时，如果消毒不严格，可能将细菌引入尿道，导致肾盂肾炎。一般导尿时间超过3天，尿路感染的发生率会明显增加。妊娠因素： 妊娠期女性由于内分泌改变和子宫增大压迫输尿管，容易出现尿液引流不畅，增加肾盂肾炎的发病风险。妊娠中晚期的女性相对更易发生肾盂肾炎。